90-е годы для угольщиков "Воркутауголь" стали ещё одной проверкой на прочность. Правительством Российской Федерации выдвинута идея реформирования угольной отрасли страны на основе реструктуризации угледобывающих объединений страны. Отраслевой принцип хозяйствования, исторически сложившийся в Воркуте, необходимо было гармонично увязать с функциями территориальных органов местного управления и самоуправления. Поэтому из системы предприятий объединения "Воркутауголь" выведены предприятия торговли и сельского хозяйства, дошкольные и спортивные учреждения, жилой фонд и жилищно-коммунальное хозяйство.

Новая логика производственно-хозяйственных отношений требовала изменения формы собственности. С 1997 года объединение "Воркутауголь" - открытое акционерное общество по добыче угля со смешанной формой собственности, в которой превалирует государственная, за счёт пакета акций, принадлежащих Российской Федерации и Республике Коми.
 
Реформирование угледобывающей отрасли должно было идти по трём направлениям: переселение нетрудоспособного населения, закрытие высокоубыточных шахт, техническое перевооружение перспективных предприятий с последующим выводом их в рентабельный режим работы.